pTypeConverterのコード読んでみましたが、
投稿タイプの変更は
UPDATE wp_posts SET post_type = “新投稿タイプ” WHERE id=投稿ID
とやってるだけみたいですね。
(エラー処理等は除く)
ということは、
特定カテゴリに所属している記事IDの一覧さえ取得できれば
特定カテゴリの記事を特定投稿タイプに変換するのは、簡単そうですね!
あとはカテゴリ設定のほうですが
管理画面で特定カテゴリの記事一覧を全表示して
一括編集することもできそうですが
今回は管理画面での操作は一切含めたくないので
ループ回して wp_set_object_terms() でいけるかなと思います。
とりあえずこのやり方で何かやってみようと思いますが
懸念すべき点あればご指摘いただければ幸いです。