自己レスで申し訳ございません、その後試したことを記しておきます。
らちがあかないので、すべてのファイルとデータベースのテーブルを削除して、新規インストールをした後にデータのインポートを試そうとしました。
インストール後、セットアップの画面(install.php）でブログ名とメールアドレスを記入し、次へ進むとSTEP2でWPのロゴのみの表示となり、その先へ進めませんでした。
（adminのパスワードが表示される画面にたどり着けませんでした）
仕方が無いのでphpmyadminにてバックアップしてあったテーブルをインポートし、サイトを確認するとやはり500エラー。PHP4.4.9にすると稼動します。
再度、同様の手順ですべてを削除し、やり直してみても結果は同じでした。
同じさくらのサーバで、同じファイルを同じ手順でセットアップしているのに・・
（ちなみに不調なのはwww1516のサーバです）
もう私には、サーバ側の環境の問題だとしか思えません。
さくらさんのサポートへ問い合わせてみます。
WPの問題ではなさそうなのでこのトピを閉じようかとも考えましたが、一応解決するまでこのままにしておこうと思います。
もしお目ざわりに思われた方がおられましたら、どうも申し訳ございませんでした。
kannomonooki様
実は2.6.1にアップグレードした時点で安心してしまい、アップグレード前に保存しておいた2.5.1でのデータベースのバックアップデータを捨ててしまいました。
それさえあれば試してみるのですが・・
その後ですが、さくらのアカウントをもう一つ取得し同環境を作ってみました。
2.6.1を新規インストールして、データのエクスポート→インポートにて構築したのですが、PHP5.2.6で正常稼動を確認できました。
となると、データベースファイルにどこか不具合があるような気がしてきました。
アップグレードの際に一部が壊れてしまったのかもしれません。
もう少し試行錯誤してみます。
アドバイスどうもありがとうございました。
