一口に「Syntax Highlighter」プラグインといっても様々な方が開発しております。
できましたらどの方が作成されたプラグインかをご呈示いただけましたらと思います。
なお使い方につきましては
コードの前後にプラグイン特有のタグを入れる必要があるプラグインがほとんどです。
（たとえば [PHP] … [/PHP] など）
またPHPとHTMLの混在ということでしたら、
基本的にPHPコードと考えて良いので [PHP] … [/PHP] でコードを挟むと良いかもしれません。
この辺りの詳細につきましては
ご使用のプラグインのサイトなどでご使用方法を確認されることをお勧めします。
この件について2009年5月7日付で提供元である the Fang of Sky より対応版が公開されました。
2009年5月7日以前にこのテーマをダウンロード・適応された方は再度ダウンロードして適応していただけましたら幸いです。
flexible-upload.phpやflexible-upload-wp25.phpをcgiとして動かしたい場合ですが、動かしたいphpファイルがあるフォルダに.htaccessを新たに作ってやる必要があります。flexible-upload.phpをcgiとして動かしたい場合の.htaccessの中身は
`<files flexible-upload.php>
AddHandler application/x-httpd-phpcgi .php
</files>`
としてしまえば動くと思いますよ。もし両方とも同じフォルダ内になるなら1つの.htaccessに列記してしまえばOKでしょう。
