今回の原因ははっきりしませんが、別のデータベースにWordPressインストールからやり直し、再設定しましたら、Contact Form7もWP-PageNaviも正常になりました。
どうもお騒がせしましたm(__)m
Takayuki Miyoshiさん、レスありがとうございます。
サーバーの OS は、Linuxです。
.htaccessですが、下記のように記載しました。
# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index\.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>
# END WordPress
AddHandler x-httpd-php5.3 .php .phps
