nocchi

私の場合は、特定のカテゴリのみ表示させたくて参考にさせていただきました。
以下のようにしたところ、指定のカテゴリに属するシングルページでのみ、投票フォームが表示されるようになりました。

<?php if (in_category('カテゴリID')) {
		if(function_exists('the_ratings')) { the_ratings(); }
	} ?>

Lyteboxの場合
新しくインストールしたURLを確認しました。
画像部分にLytebox呼び出し用のコードが入っていないようです。
以下のように、投稿に画像が挿入されているだけになっています。

<img src="http://www.teruteru-factory.com/memento/wp-content/uploads/2009/04/img_2642-150x112.jpg" alt="ハンバーガー" title="ハンバーガー" width="150" height="112" class="alignnone size-thumbnail wp-image-162" />

Lyteboxを動作させるには、以下のようになっている必要があります。

<a href="images/image.jpg" rel="lytebox"><img src="images/image-thumbnail1.jpg" /></a>

「rel=”lightbox”」ではなく、rel=”lytebox”である点にも注意してください。

ソースが不十分なのは、プラグイン適用後に投稿していないからですか？
それとも、投稿したけれどコードが付与されないとか、投稿環境など他の影響でしょうか？

参考
Lyteboxの使い方
http://www.syboos.jp/opensource/bookmark/detail/lytebox.html

カテゴリを手動で並べ替えるプラグインに、MyCategoryOrderというものがあります。
手動で構わないなら、こういったプラグインの出力部分をカスタマイズした方が簡単そうだと思います。
例えば、以下二点のカスタマイズを加えればそっくりになりませんか。
・出力されるリスト部分の左端にボタン画像を表示させる
・JavaScriptでリストを開いたり閉じたりできるようにする

どういった制御をお考えなのでしょう？

参考

・MyCategoryOrder
http://wordpress.org/extend/plugins/my-category-order/

・JavaScript　ブロック要素の表示非表示切り替え

function expd(id) {
    if(document.getElementById(id).style.display == "block")
        document.getElementById(id).style.display = "none";
    else
        document.getElementById(id).style.display = "block";
}

スイッチにするタグにつける例

<li onclick="javascript:expd('exp')">見出し</li>

予め隠しておいてスイッチをクリックすると表示されるようにするブロック要素につける例

<ul id="exp" style='display:none;'>
<li>見出し</li>
</ul>

上記二点を入れ子型にする

<ul>
  <li onclick="javascript:expd('exp')">（親）見出し
    <ul id="exp" style='display:none;'>
      <li>（子）見出し</li>
    </ul>
  </li>
</ul>

以下のようにしたところ、最初に配置した画像がサムネイル表示されるようになりました。
参考記事のようにループタグ内にコードを追加して試しました。
ご希望に沿ったものか分かりませんがいかがでしょう。

$files = get_children("post_parent=$id&post_type=attachment&post_mime_type=image");
if($files){
        $keys = array_keys($files);
        $lastkeys = array_pop($keys);
        $num=$lastkeys;
        $thumb=wp_get_attachment_thumb_url($num);
        print '<a href="' . clean_url(get_permalink()) . '" title="' .the_title_attribute('echo=0') . '"><img class="thumbnail" src="' . clean_url($thumb) .'" alt="' . the_title_attribute('echo=0') . '" /></a>' . "\n";}