私は最新バージョンにしても、バグが直らなかったのですが、
@kimipooh さんを参考に
class-wc-address-field-4jp.php
の中にある
//Add Ken and Fu to prefectures in Japan.
こちらの下に表記されてある都道府県一覧に
$states[‘JP’][‘JP01’] = __( ‘Hokkaido’, ‘woocommerce’ );
$states[‘JP’][‘JP13’] = __( ‘Tokyo’, ‘woocommerce’ );
こちらを追加した所バグが修正されました!
@kimipooh さんありがとうございました!