LVP8さん、返信ありがとうございます！
サイドバー部分にも使っていたので、ページネーションの後にwp_reset_query()を持っていったら実現できました。
query_posts()で設定した表示件数を、ページネーションに引き継ぐ前にwp_reset_query()でリセットしてしまっていた… という解釈でいいのでしょうか。
それならページ送りが希望通りにいくわけもないですね…
だいぶ長い事悩んでいたので、本当に助かりました！
これで解決済みにさせて頂きます。どうもありがとうございました！！
アドバイス下さったお二方、ありがとうございます！
悩みに悩んでいたもので、とても嬉しかったです。
早速ループ内の
the_post_thumbnail();
を
the_post_thumbnail('full');
にしてみるところから始めてみたら、フルサイズの元画像がサムネイル画像として表示されました。
もしかしたらと思って
the_post_thumbnail('thumbnail');
にしてみたところ、任意の位置で切り抜いて、メディアライブラリ等にも表示されている画像が表示されました。
投稿編集画面の『投稿サムネイル（3.0以降はアイキャッチ画像）』欄の画像は相変わらず自動で切り抜かれたものですが…
考えていた事は達成できたので、とりあえず『投稿サムネイル』欄の画像は無視して、画像をトリミングした時にできる『現在のサムネイル画像』を信じる事にします。
どうもありがとうございました！
