Fumito MIZUNO

twenty fourteenにテーマを戻してみたところ、正常の動きをしております。

このような状況だとすると、
テーマ（の設定）が適切でない
という可能性が高いと思われます。

初めての方は必ずお読みくださいは ＞ ja.forums.wordpress.org/topic/13

wordpressのテンプレートタグを使ってリンクを表示するようにすれば、
/hokkaido/sapporo/
といったURLになるはずですから、
現状で問題ないのではないでしょうか。

おそらく、zlib(ファイルの圧縮などを行う機能)に問題がありますね。この機能がサーバー側で無効、もしくは圧縮解凍できるフォルダが制限されている可能性が高いです。

サーバー管理会社へ問い合わせてみたところwordpressの方の問題という返事をいただきましたが、どうすればよいのかわからず…。

サーバー会社で対応していただけない、となると、そのサーバーでは、
「自己責任で自分で設定を行う」か、
「アップデートは手作業で行う」か、
あたりだと思います。

「RSS配信をするようにしたい」が、「著者ごとの投稿のRSSを作りたい」でしたら、
デフォルトで対応しています。

ブログのURL/?feed=rss2&author=1
ブログのURL/?feed=rss2&author=2

のようなURLにアクセスすればRSSを取得できます。

「RSS配信をするようにしたい」が他の意味でしたら、詳細な説明をお願いします

ひとまず、↓のコードで試してもらえますか？

foreach ($users as $user) :
	$my_posts = get_posts (
	array(
	'author'=> $user->ID,
	'post_type' => 'staffcolumn'));
	$n = count($my_posts);

	echo $n;
    endforeach;

get_posts のところがおかしいのか、それとも、以後の表示させる部分でおかしいのか、のチェックです。

パーマリンクの設定には関係なく、トップページがアーカイブを表示する形式になります。

example.com/archives/1 <= 個別の記事
example.com/ <= トップページ、記事一覧

「全件」というのが文字通り、「記事数がどんなに多くても全部表示」だとカスタマイズが必要になりますけど。

デフォルトでない場合は、デフォルトに戻しても現象が発生するかどうか
を確認すれば、テーマに問題があるかどうか分かりますよ。

もしテーマに問題があれば、
公式テーマ等きちんと作られているテーマをベースにする
で良いのではないでしょうか。