shokun0803さん、bonopsさん返信ありがとうございます。
自分の環境だけかと頭抱えていましたので助かりました。
症状としてはbonops様の#8613でした。
そもそもこのようなことをお聞きしましたのが、投稿画面のカテゴリ選択(メタボックス)時、小カテゴリを選択すると親カテゴリも自動にチェックされるように出来ないかjQrueryでいろいろ試していました。新規追加での投稿時はなんとか制御出来たのですが、既に投稿されている記事の再編集を行う際に、カテゴリの順番がぐちゃぐちゃになっていてアレレ・・・。
バグとして認識されているようですので気長に待ちたいと思います。
お時間を割いていただき、ありがとうございました。