stranger-jp

直近で行った作業が原因になっていませんか？
プラグインを追加したとか、テーマを編集したなど。
思い当たるものがあれば、元に戻してみてください。

尚、本件と無関係ですがソースを見ていましたら
<h1 class="menu-toggle">メニュー</h1>
このような記述がありました。
これが意図したものかどうか不明ですが、恐らく適切ではないと思われます。
併せてSEO絡みの設定も見直された方が宜しいかと思います。

プラン次第かと思います。
あとはサイトの構成。
プラグインが少なければ低負荷で済みますが、幾らかは使いますよね？

さくらインターネットならスタンダードであれば
WordPressを1つ、そこへプラグインを十数個有効にしただけで、
まともにサイトが表示されなくなったりします。

サーバーに対し低負荷なのは当然マルチサイト機能を使う方法ですが、
それが良いのか悪いのか決めるのは貴方なので私には判りません。
お金に余裕があれば高性能なサーバーを契約すれば余計な心配無用です。

まだ構想段階であればお試し期間を利用して想定する構成で
サイトを構築してみてはいかがでしょうか。
4つも入れるならスタンダードは端から使えないと思って諦めてください。

プラグイン、.htaccess、サーバーの設定で特定のUAに対して
何らかのアクションを起こすような設定になっていませんか？

IE10のキャッシュや履歴を全消去して変化が無いようでしたら
WordPressでご使用中のプラグインを全停止するなど試してみてください。
IEは何かと問題があるので面倒ですね。

メールが届いた時点でアップデート済かと思います。
なので更に更新ボタンを押下したのは無意味であると思われます。

日本語最新版をダウンロード、展開し、FTPクライアント等を用いて
展開したファイルを上書きアップロードしてください。
必要なファイルは予め退避しておくのをお忘れなく。