もう古い投稿で解決されているようですが、
私も同じ現象になって困って、プログラムを追って調べてみました。
結論から言うと、無事解決できました。
編集したのは以下のファイル。
/wp-content/plugins/movabletype-importer/movabletype-importer.php
の102行目辺り。
// function fgets($fp, $len=8192) { ↓に変更
function fgets($fp, $len=81920) {
(wordPressのバージョンは3.5.1です。)
1記事の内容が8192バイトに達した時点で不明なコードが挿入されてしまい、
データベースに格納する時点でそこまでの文章として認識してしまっていたようです。
他に良い修正方法があるかもしれないですが、、暫定措置的には使えるかなぁ、と思います。
私のブログにも書いておきました~。
AT-CENTRAL