chestnut_jp様
早速のご返答ありがとうございます。
> どこかにデータベース情報が残っていると考えるのが妥当
とのことで全く予想が立たなかった中での作業から解放されました。
FTPで詮索したところ結果的にはやはり自分の思い違いによるものでした。
public_html内に置いていたコアパッケージは実際は使用されておらず
その上位ディレクトリに実際には使用されていたコアパッケージがありました。。
インストール時が2年前のことで、当時適当に入れたことが祟りました。
ご迷惑おかけしました。
ありがとうございました。