PHPのmemory_limitじゃないでしょうか？
php.iniにありますがお使いのサーバによってユーザーが見られる・いじれるとは限りません
ただそれならば自動アップデートを使わずに
2.7以前の自動アップグレードがなかった頃と同様に
下記のURLを参考に手動で作業すれば済むことですよ
http://wpdocs.sourceforge.jp/WordPress_%E3%81%AE%E3%82%A2%E3%83%83%E3%83%97%E3%82%B0%E3%83%AC%E3%83%BC%E3%83%89/%E8%A9%B3%E7%B4%B0
そもそも3.3.1(3.2以上)の動作要件を満たしていないような
動作環境
WordPress 3.2 日本語版
PHP バージョン 5.2.4 以上
MySQL バージョン 5.0 以上
