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>speaklow さん
履歴保存の機能を無効にすれば、とりあえずは回避できますね。
2.6の新機能ですが、この機能が不要ということなら無効にしてみてはいかがでしょうか。
無効の方法などは、Codex の Revision Managementの項に説明がありますが、wp-config.php に
define (‘WP_POST_REVISIONS’, false);
という行を追加すれば良いです。
「WordPress2.6 リビジョン管理」 で検索すると日本語で説明したページもヒットしますので、あわせて参考にしてみてください。

>cwicさん
最低限の使い方は、プラグイン名で検索すれば、日本語で書かれた解説ページも見つかるかと思います。2.5対応版が出たのが最近で、Web 上の情報は古いバージョンのものが多いですが、基本的な使い方は変わっていないはずです。

また、配布ページの中程にある、Tips & Examples を参考にして下さい。
例えば、カテゴリーID1の最近の記事を3件表示するには、テーマの表示したい場所に
<?php c2c_get_recent_posts(3,"<li>%post_date% %post_URL%</li>",'1','date','DESC',0,'Y.m.d'); ?>
と書けば li タグで囲まれて出力されます。その他のオプションの意味はページを和訳サイトなどを使って解読して下さい。

管理画面にて、
管理 → リンクカテゴリ
へ移動し、変更したいカテゴリ名を編集すれば良いと思います。

プラグインに、Smart Update Pinger というものがあます。
更新通知のログも見ることができますので、それで Ping 送信の成否は確認できます。

また、 Pingoo! のような複数のサイトへ更新通知を代理してくれるサービスもありますので、そちらの利用も検討してみてはいかがでしょう。

>mugifumi さん
ああ、いえ。
インストールの方法は、
1.mylinkorder.php をプラグインディレクトリにコピー
2.taxonomy.php (MyLinkOrderのアーカイブに同梱されているもの)を/wp-includes/へコピー
という2つの手順が必要なので、2の手順を行った記憶がないようなら、再度やってみてはどうかということでした。
念のため、アーカイブを http://wordpress.org/extend/plugins/my-link-order/ からダウンロードし直し、インストールをやり直してみてはどうでしょうか。

>tgin さん
テンプレートタグの記述は、実際には
<?php wp_list_bookmarks('orderby=order&category_orderby=order'); ?>
ですかね。
default テーマの場合は、53行目くらいに
<?php wp_list_bookmarks(); ?>
という部分があるので、() 内を readme.txt 通りに書き換えてみたらどうでしょうか?
また、テンプレートタグには様々なオプションがありますので、それらについては検索していただくのが良いかと思います。

>mugifumi さん
私はウィジェットの方を使用していますが……。
WordPress のキャッシュ機能を使っていたりすると、一時的に反映されないことがありました。
また、 My Link Order 2.2 には taxonomy.php は同梱されていませんが、こちらは wp-includes へ正しくコピーされていますでしょうか?
思いつく点はこんなところです。

>tgin さん
プラグインで自由な並び替えを実現するものもあります。

• My Link Order
• My Catagory Order

ご参考までに。