waka

　お返事ありがとうございます。
　お手数かけますが、教えて頂けないでしょうか？
　query_postsが実行される前の状態でもWordPressがリクエストされたURLを表示できるかは、どのようにして確認したら良いでしょうか？
　
　コードはcategory-○.phpを作って以下のように記述しています。

<?php get_header(); ?>

<div class="txt_txt2">

<?php
$pag = get_query_var('paged');
query_posts('cat=26&posts_per_page=5&paged='.$pag); ?>

<?php if(function_exists('wp_pagenavi')) { wp_pagenavi(); } ?> 

<?php if (have_posts()) : ?>
	<?php while (have_posts()) : the_post(); ?>
	<?php the_title(); ?>　：　<?php the_time('Y/m/d')?>
	<?php the_content(__('続きを読む')); ?>
	<?php endwhile; ?>
<?php else : ?>

err...?

<?php endif; ?>
<?php if(function_exists('wp_pagenavi')) { wp_pagenavi(); } ?> 

</div>

<?php get_footer(); ?>

　パーマリンク設定をカスタム構造にしているため、ページング後のurlが
http://example.org/category/categoryname/page/2/　
となるので.htaccessの設定を疑いましたが、.htaccessは正しく設定されていました。
　また、パーマリンク設定をデフォルトに戻しても404です。

　試行錯誤していく中で、WordPressのバージョンをWordPress 2.9.2に戻すと、正常に動作しました。
　バージョンアップで、何か変わったのでしょうか。