サーバはこちらで自前で用意して、DNS設定でja.codex.wordpress.orgを割り振っていただくというのはどうでしょう。Nucleus日本公式などはそんなふうにしてますが、適当に負荷を分散できるなどの副次効果もあったりして具合いいです。
wikiを分けること自体は、どなたかもおっしゃってたかもしれませんが、たとえばプラグインを自作しようとして「add_option」あたりのキーワードで検索したら英語の情報ばかり出てくるというのはちょっと不便だと思います。MediaWikiにはwiki間の連携をとる機能もあるようですし、そのへんはうまく連携しつつ棲み分けができるのでは。スキンは本家から分けてもらえたら、見た目は別サーバという感じもなくなじむと思います。
横から失礼します。yamaと申します
> サーバー会社にスペースと管理リソースを寄付してもらう…とかいう選択肢はありますか?
少し前に、Drupal Japanのスポンサーが離れることになって、新しいスポンサーを急遽募集した話がありました。結果、NTTコミュニケーションズやファーストサーバ社など大手含む12社からの名乗りがあり、それなりに盛り上がった様子です。体制を整えて信用をそこそこアピールできれば、そういう道もあるのではと思います。